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長庚醫院承認，和主治醫師屬於「雇傭關係」，而不是「合夥關係」，接下來，為數不少的醫生將收到國稅局的補稅單。財政部將在收到衛生署的認定公文後，由五區國稅局全面發動補稅，追溯期五年，從九十四年到九十八年，如果是逾期申報案件，再往前兩年，從九十二年到九十八年。長庚醫院被檢舉，以駐診合夥的名義，向醫師收取全額健保費，衛生署認定，長庚也承認，所有長庚醫師都是受到醫院雇用，不是合夥關係，雖然保住長庚醫學中心的資格，但是大批醫生都可能被補稅。財政部次長張盛和說，會在收到衛生署的公文，註明哪些醫院和醫師屬於雇傭關係，而非合夥關係，先針對名單補稅。「醫療的東西，國稅局比較難認，你看衛生署這麼久以來，也都現在才認定」國稅局指出，補稅核課期是五年，會回溯到九十四年到九十八年，如果是逾期申報案件，核課期七年，會回溯到九十二年到九十八年。醫生屬於高所得族群，衛生署粗估，補稅金額在十幾億元，國稅局即將吃下大補丸，但張盛和說，目前還無法估計金額。「是不是有多少人是這樣？有多少醫院是這樣？有多少年？這不好估」醫院醫師「合夥」，通常是醫師也有出資購買醫療設備，也要負擔醫院診所經營成敗的責任，合夥關係才可以拆帳，列在成本費用節稅；但醫生只要看診，不必承擔醫院診所經營的風險，屬於雇傭關係，比照一般受薪階級課稅。國稅局指出，醫生會打探哪家醫院的「福利」比較好，醫療院所會互相模仿，出示契約聲稱是合夥拆帳，讓國稅局難以認定。（責任編輯：李竺禪）